dc.contributor |
Universitat de Vic. Grup de Recerca en Bioinformàtica i Estadística Mèdica |
|
dc.contributor.author |
Calle, M. Luz
|
|
dc.contributor.author |
Urrea Gales, Víctor
|
|
dc.contributor.author |
Malats i Riera, Núria
|
|
dc.contributor.author |
Van Steen, Kristel
|
|
dc.date.accessioned |
2008-02-05T12:54:06Z |
|
dc.date.accessioned |
2012-03-30T09:39:46Z |
|
dc.date.available |
2008-02-05T12:54:06Z |
|
dc.date.available |
2012-03-30T09:39:46Z |
|
dc.date.created |
2008-01 |
|
dc.date.issued |
2008-02-05T12:54:06Z |
|
dc.identifier.uri |
http://hdl.handle.net/10854/408 |
|
dc.description.abstract |
L’anàlisi de l’efecte dels gens i els factors ambientals en el desenvolupament de malalties complexes és un gran repte estadístic i computacional. Entre les diverses metodologies de mineria de dades que s’han proposat per a l’anàlisi d’interaccions una de les més populars és el mètode Multifactor Dimensionality Reduction, MDR, (Ritchie i al. 2001). L’estratègia d’aquest mètode és reduir la dimensió multifactorial a u mitjançant l’agrupació dels diferents genotips en dos grups de risc: alt i baix. Tot i la seva utilitat demostrada, el mètode MDR té alguns inconvenients entre els quals l’agrupació excessiva de genotips pot fer que algunes interaccions importants no siguin detectades i que no permet ajustar per efectes principals ni per variables confusores. En aquest article il•lustrem les limitacions de l’estratègia MDR i d’altres aproximacions no paramètriques i demostrem la conveniència d’utilitzar metodologies parametriques per analitzar interaccions en estudis cas-control on es requereix l’ajust per variables confusores i per efectes principals. Proposem una nova metodologia, una versió paramètrica del mètode MDR, que anomenem Model-Based Multifactor Dimensionality Reduction (MB-MDR). La metodologia proposada té com a objectiu la identificació de genotips específics que estiguin associats a la malaltia i permet ajustar per efectes marginals i variables confusores. La nova metodologia s’il•lustra amb dades de l’Estudi Espanyol de Cancer de Bufeta. |
cat |
dc.format |
application/pdf |
|
dc.format.extent |
14 p. |
ca |
dc.language.iso |
eng |
ca |
dc.rights |
Aquest document està subjecte a aquesta llicència Creative Commons |
cat |
dc.rights.uri |
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ |
|
dc.subject.other |
Bioinformàtica |
|
dc.subject.other |
Biometria |
|
dc.subject.other |
Mineria de dades |
|
dc.subject.other |
Epidemiologia genètica |
|
dc.title |
MB-MDR: Model-Based Multifactor Dimensionality Reduction for detecting interactions in high-dimensional genomic data |
ca |
dc.type |
info:eu-repo/semantics/workingPaper |
ca |
dc.rights.accessRights |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
|