En los últimos diez años, la investigación en el campo de silenciamiento de RNA se ha centrado
en la localización subcelular en estado estacionario de las proteínas ARGONAUTA y sus funciones
como efector final de rutas específicas de RNA. Sin embargo, sus rutas exactas de importación/
exportación y localización transitoria han ...»»»»
En los últimos diez años, la investigación en el campo de silenciamiento de RNA se ha centrado
en la localización subcelular en estado estacionario de las proteínas ARGONAUTA y sus funciones
como efector final de rutas específicas de RNA. Sin embargo, sus rutas exactas de importación/
exportación y localización transitoria han permanecido completamente desconocidas en todos
los organismos eucariotas.
El objetivo principal de este trabajo se basa en estudiar la conservación de señales de
localización subcelular de proteínas ARGONAUTAS en el Clado I de Arabidopsis con la finalidad
de entender los procesos nucleares y citoplasmáticos que estas proteínas llevan a cabo.
Para ello, las señales de localización nuclear (NLS) y las señales de exportación nuclear (NES) de
AGO1, AGO5 y AGO10 predichas por los programas de predicción de señales canónicas se han
filtrado por exposición de las respectivas señales al entorno. Aquellas que han superado el filtro,
se han ubicado en la secuencia de aminoácidos respectiva, se han comparado mediante un
alineamiento de secuencia de aminoácidos entre AGO1, AGO5 y AGO10 de Arabidopsis y,
finalmente, se han comparado con sus respectivos ortólogos.
Los resultados obtenidos sugieren la presencia de señales de exportación nuclear (NES)
conservadas y funcionales ubicadas en una posición similar en el N-Coil de AGO1, AGO5 y
AGO10. Estos resultados refuerzan las evidencias previas y sugieren que estas proteínas se
localizan de una forma estacionaria en el citoplasma.^^^^
In the past ten years, research in the RNA silencing field has focused on AGO’s steady-state
subcellular localization and functions as final effector of specifics RNA pathways. However, their
exact import/export routes and transient localization have remained completely unknown in all
eukaryotic organisms.
The main objective ...»»»»
In the past ten years, research in the RNA silencing field has focused on AGO’s steady-state
subcellular localization and functions as final effector of specifics RNA pathways. However, their
exact import/export routes and transient localization have remained completely unknown in all
eukaryotic organisms.
The main objective of this work is based on studying the conservation of subcellular localization
signals in Clade I of Arabidopsis in order to understand the nuclear and cytoplasmic processes
that carry out with microRNAs.
For this, first nuclear localization signals (NLS) and nuclear export signals (NES) of AGO1, AGO5
and AGO10 predicted by canonical prediction signal programs were filtered by accessibility.
Those that pased the filter, were located on the respective amino acid sequence, compared by
amino acid sequence alignment between AGO1, AGO5 y AGO10 of Arabidopsis and with their
respective orthologous.
The results obtained suggest the presence of conserved and functional nuclear export signals
(NES) located on similar position on the N-Coil of AGO1, AGO5 and AGO10. These results are in
agreement with the previous evidence that suggest that these proteins are located in a steady
state in the cytoplasm.^^^^
